马非百、李开元等史学家认为，其中秦始皇侄子一说最为合理。
首先，二世兄之子说与史实存在矛盾。后来，子婴与儿子谋划刺杀赵高，可见其儿子在秦朝末年已成年，而子婴本人也至少30岁左右。秦始皇死时50岁，其长子扶苏大概30余岁，不可能有子婴年龄这么大的孙子。
其次，二世之兄说，也与之前诸公子被屠杀殆尽的事件相矛盾，尤其是在子婴冒死直谏后还能有幸逃过一劫，实在难以置信。
根据史书记载，秦始皇只有三个弟弟，其中他母亲赵姬与男宠嫪毐生下的两个私生子早已死于嬴政夺权时，尚在襁褓就被残忍扑杀。马非百先生推测，子婴应该是嬴政另一个弟弟长安君成蟜的儿子。
嬴政即位之初，秦国政治斗争波云诡谲。成蟜不愿卷入朝中权斗，在秦王政八年（公元前239年）带兵出征时向赵国投降，当时不过20岁左右。一说成蟜投降后客居于赵国，从此再未回到秦国。马非百认为，如果子婴是其在离开秦国前生下的孩子，那么《史记》中“召始皇弟子婴，授之玺”一句，就有另一种合理解读——子婴是始皇弟之子，名为嬴婴。
