宋太宗听了这话，觉得有理，便询问如何安顿李母。吕端建议将李母安顿在延州城，善加照顾，以此瓦解分化叛军。这招攻心之术十分巧妙，最终李继迁又重新归附宋朝。
在对待李继迁的问题上，吕端高瞻远瞩，纠正了皇帝的错误，避免了大的损失。而在皇位继承、关系到江山社稷的大事上，吕端更能坚持原则，努力维护大宋王朝的安定。
至道三年（997年），宋太宗赵光义病危。当时内侍王继恩担心太子赵恒上台后会对自己不利，就暗中串通皇后，勾结副丞相李昌龄、殿前都指挥使李继勋等人图谋废除太子，另立楚王赵元佐为皇帝。一场宫廷政变正紧锣密鼓地进行着。吕端察知端倪后，秘密地让太子赵恒入宫，筹谋对策。太宗死后，皇后马上令王继恩来召吕端入宫。吕端察觉王继恩神色有异，知道事情有变，于是命人将王继恩锁在书房，而自己则冒着生命危险孤身去见皇后。皇后见了吕端，果然向他提出了废太子、立楚王的想法。吕端当即表示反对，对皇后说：“先帝在位的时候，已经确立了太子，我们怎么能不听他的话呢？”
皇后见吕端反对，便沉默不语。吕端见皇后犹豫不决，说道：“王继恩意图谋反，已经被我抓起来了，还是赶快拥立太子安定天下。”皇后见谋变的王继恩已经成擒，计无可施，只得让太子赵恒继位。太子赵恒继位这天，垂帘接受众臣的朝拜。吕端担心有诈，请求皇帝卷帘听朝。在确认了皇帝之后，吕端这才率领众臣跪拜，庆贺宋真宗赵恒登基，随后又将作乱之人发配外地，从而巩固了新皇政权。